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上課所需軟體,請學員事先下載:
1.請下載Mango軟體,依指示安裝於筆電上(Mac/Windows/Linux適用)。
2.在筆電上安裝MATLAB (2013b版本以上),確認可以開啟命令視窗(command window)。
3.註冊後免費下載SPM12。解壓縮後,在MATLAB中設置路徑(set path)指向SPM12資料夾 (包含底下所有子目錄,目錄名稱請避免以中文命名,否則無法正確開啟)。
4.下載範例檔案:(請參考如下“上課資料壓縮檔連結”並預先下載)
Matlab(如學校有提供校園版,可安裝校園版;或請學員自行購買) 授課老師使用版本2020b。
SPM12(https://www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm/software/download/) 授課老師使用版本SPM12 (7771)。
Mango(https://ric.uthscsa.edu/mango/download.html) 請同學依照電腦OS下載合適安裝檔。
上課資料壓縮檔(連結:https://drive.google.com/file/d/1Jbcuu2XKTxOaVf_CoEI9Uh_J29UtkAfx/view)
檔名:HandsOn_task_fMRI 大小:519.3 MB 解壓縮後約1.25G,HandsOn_task_fMRI資料夾內,包含資料如下(資料夾以📂標示):
。📂 1_DICOM
▪️ 📂 A04 ▪️📂 T1 :176個檔案 ▪️📂 TASK_ANKLE :180個檔案 ▪️📂 TASK_GRASP :180個檔案 ▪️TASK_Paradigm.txt 檔案
📂 2_Preprocessing 📂 A04 📂 T1:空的預建資料夾。 📂 TASK_ANKLE:空的預建資料夾。 📂 Step1_slice_timing:空的預建資料夾。 📂 Step2_motion_correction:空的預建資料夾。 📂 Step3_normalization:空的預建資料夾。 📂 Step4_smoothing:空的預建資料夾。 📂 Step5_1st-level_GLM:空的預建資料夾。 📂 TASK_GRASP:空的預建資料夾。 內容同 📂 TASK_ANKLE 📂 A04_Done_for_Check 同上述A04 資料夾結構,然📂T1與📂TASK_GRASP內已經有跑好的結果以供同學參考。 📂 3_FirstLevel 📂 A04_TASK_GRASP:空的預建資料夾。 📂 A04_TASK_GRASP_Done_for_Check:已分析完成的結果供同學參考。 📂 4_GroupAna 📂 1_One_Sample_T/2_Two_Sample_T/3_Paired_T/4_2x2_ANOVA:空的預建資料夾。 📂 Ankle_Left/Ankle_Right/Grasp_Left/Grasp_Right:用作群組分析用的檔案。 每個資料夾皆含16筆資料檔案。 MNI152_T1_2mm.nii 檔案:於標準空間之結構影像檔
* 實作課程請學員自備筆記型電腦,並務必先自行安裝matlab、SPM軟體及其他課程指定軟體 *